基础化学实验室有面积为120m2的学生实验室2间，面积为30m2的预备室1间。主要设备有GZX—DH—BS（S）—II系列电热恒温干燥箱，生物安全柜，投影仪，PP挥发排风试剂柜，循环多用水式真空泵，容声电冰箱，吸顶空调，进行常规教学的成套仪器100套，配套的实验桌、水槽、各种实验试剂等。并为实验室量身定做了通风柜与通风系统，使用有毒试剂或实验过程中产生的有毒气体能及时被设备排出，减少实验室环境的污染。实验室仪器设备总价值达71.7万元。通过化学实验培养学生的基本操作技能，它的教学目的掌握有关的化学基本知识、基本原理及基本实验技能，了解这些知识、理论和技能在医学上的应用，培养分析和解决涉及化学实际问题的能力，培养学生一丝不苟、严谨治学的科学态度，为今后的学习和工作打下一定的化学基础。